淡水生物
※展示生物，根据时期不同会有变更。
佐佐川、相浦川、江迎川等较大的支流汇入九十九岛，这些支流的四周有鱼虾、贝类等繁衍生息的水田环绕，故而其生物的多样性得以保存。
丰裕的源头「佐佐川」
青鳉
新米虾
川鯥
暗缟鰕虎鱼
丰裕的源头「佐佐川」
以国见山为源头，流淌在长崎县北部的佐佐川是县内最长的川流，汇入九十九岛。河口的泥潭里生活着蟹类贝壳类生物。营养丰富的水源，汇入九十九岛。物产丰富的佐佐川便是九十九岛丰裕海域形成的源头。
自然与人类的共存「小运河」
自然与人类的共存「小运河」
小运河是给田地引水灌溉时而挖掘的。虽然是人工挖掘的小运河，但是却有许多生物栖息在此处，是自然和人类的共存产物。佐世保周边的小运河里已有确认是青鳉、虎鱼等珍贵物种的存在。
